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Bootstrap: docker
From: debian:buster
IncludeCmd: yes
%labels
AUTHOR icaoberg
EMAIL icaoberg@alumni.cmu.edu
WEBSITE http://www.andrew.cmu.edu/~icaoberg
VERSION 5.1.0
%post
apt-get update && apt-get install -y \
wget \
libopenmpi-dev \
openmpi-bin \
ghostscript \
libgs-dev \
libgd-dev \
libexpat1-dev \
zlib1g-dev \
libxml2-dev \
autoconf automake libtool \
libhtml-template-compiled-perl \
libxml-opml-simplegen-perl \
libxml-libxml-debugging-perl \
sudo \
openssh-server
wget -nc http://meme-suite.org/meme-software/5.1.0/meme-5.1.0.tar.gz
tar -xvf meme-5.1.0.tar.gz && rm -fv meme-5.1.0.tar.gz
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install Log::Log4perl'
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install Math::CDF'
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install CGI'
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install HTML::PullParser'
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install HTML::Template'
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install XML::Simple'
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install XML::Parser::Expat'
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install XML::LibXML'
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install XML::LibXML::Simple'
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install XML::Compile'
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install XML::Compile::SOAP11'
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install XML::Compile::WSDL11'
PERL_MM_USE_DEFAULT=1 perl -MCPAN -e 'install XML::Compile::Transport::SOAPHTTP'
mkdir /opt/meme
mv -v meme-5.1.0 /opt/meme
cd /opt/meme/meme-5.1.0 && \
./configure --prefix=/opt/meme --enable-build-libxml2 --enable-build-libxslt --with-url=http://meme-suite.org && make && make install
####################################################################################
%apphelp meme
/opt/meme/bin/meme --help
%apprun meme
/opt/meme/bin/meme "$@"
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/opt/meme/bin/meme-chip --help
%apprun memechip
/opt/meme/bin/meme-chip "$@"
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/opt/meme/bin/dreme "$@"
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/opt/meme/bin/glam2 "$@"
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/opt/meme/bin/momo "$@"
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