Lab4.md

实验四

一、实验目的

1. 了解生物的RNA种类，真核生物mRNA的特点及如何分离纯化
2. 了解RNA、DNA比对的区别
3. 掌握DESeq2分析DE基因方法

二、知识回顾

转录组测序（RNA-Seq）应用非常广泛，目前测序市场有超过一半做的是转录组。
转录组没序是对生物体内所有的RNA进行测序，一般可以按测序鞋标不同而分为
mRNA，microRNA, total RNA测序，传统意义上的RNA-Seq指的是mRNA测序。一般
RNA-Seq项目分析包括以下几个步骤：

1. 序列质控
2. 将得到的clean reads 回帖到参考基因组
3. 计算每个基因的reads数
4. 比较不同组之间的DE基因
5. DE基因的功能挖掘

本实验主要介绍DESeq2的使用，DESeq2是用来做差异基因分析的一套R软件包，

三、上机操作

四、作业与思考

五、参考文献