-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
index.html
1059 lines (996 loc) · 49.2 KB
/
index.html
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
<!-- <!DOCTYPE html> -->
<html lang="en">
<head>
<meta charset="utf-8" />
<meta name="viewport" content="width=device-width initial-scale=1" />
<meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=edge" />
<!-- Materialize - Compiled and minified CSS-->
<link rel="stylesheet" href="https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/materialize/0.95.3/css/materialize.min.css" />
<!-- Font Awesome Icon - CSS-->
<link rel="stylesheet" href="https://maxcdn.bootstrapcdn.com/font-awesome/4.3.0/css/font-awesome.min.css" />
<!-- Custom Styles-->
<link rel="stylesheet" href="./assets/css/style.css" />
<title>Jérémy Martin | Data Engineer</title>
<!-- Google tag (gtag.js) -->
<!-- //TODO : Add Cookies pop up -->
<!-- <script async src="https://www.googletagmanager.com/gtag/js?id=G-5VRPC76GG1"></script>
<script>
window.dataLayer = window.dataLayer || [];
function gtag(){dataLayer.push(arguments);}
gtag('js', new Date());
gtag('config', 'G-5VRPC76GG1');
</script> -->
<!-- Open Graph-->
<meta property="og:locale" content="en_US" />
<meta property="og:type" content="website" />
<meta property="og:title" content="Jérémy Martin | Data Engineer" />
<meta property="og:description" content="Data scientist" />
<meta property="og:url" content="https://martin-jeremy.github.io/" />
<meta property="og:site_name" content="Jérémy Martin | Data Engineer" />
<meta property="article:publisher" content="https://martin-jeremy.github.io/" />
<meta property="og:image" content="https://martin-jeremy.github.io/examples/preview.JPG" />
<meta name="author" content="Jérémy Martin" />
<meta name="description" content="Data Engineer and QA Expert with a passion for automatisation and algorithmics." />
<link rel="apple-touch-icon" sizes="57x57" href="./assets/img/favicon/apple-icon-57x57.png" />
<link rel="apple-touch-icon" sizes="60x60" href="./assets/img/favicon/apple-icon-60x60.png" />
<link rel="apple-touch-icon" sizes="72x72" href="./assets/img/favicon/apple-icon-72x72.png" />
<link rel="apple-touch-icon" sizes="76x76" href="./assets/img/favicon/apple-icon-76x76.png" />
<link rel="apple-touch-icon" sizes="114x114" href="./assets/img/favicon/apple-icon-114x114.png" />
<link rel="apple-touch-icon" sizes="120x120" href="./assets/img/favicon/apple-icon-120x120.png" />
<link rel="apple-touch-icon" sizes="144x144" href="./assets/img/favicon/apple-icon-144x144.png" />
<link rel="apple-touch-icon" sizes="152x152" href="./assets/img/favicon/apple-icon-152x152.png" />
<link rel="apple-touch-icon" sizes="180x180" href="./assets/img/favicon/apple-icon-180x180.png" />
<link rel="icon" type="image/png" sizes="192x192" href="./assets/img/favicon/android-icon-192x192.png" />
<link rel="icon" type="image/png" sizes="32x32" href="./assets/img/favicon/favicon-32x32.png" />
<link rel="icon" type="image/png" sizes="96x96" href="./assets/img/favicon/favicon-96x96.png" />
<link rel="icon" type="image/png" sizes="16x16" href="./assets/img/favicon/favicon-16x16.png" />
<link rel="manifest" href="./assets/img/favicon/manifest.json" />
<meta name="msapplication-TileColor" content="#ffffff" />
<meta name="msapplication-TileImage" content="./assets/img/favicon/ms-icon-144x144.png" />
<meta name="theme-color" content="#ffffff" />
<meta name="robots" content="index, follow" />
<!-- Google Site Verification for indexing -->
<!-- //TODO -->
</head>
<body>
<!-- Google Tag Manager (noscript) -->
<!-- //TODO -->
<!-- Navigation Menu-->
<!-- Nav class 1 -->
<nav class="hide-on-small-only">
<ul class="side-nav fixed section table-of-contents">
<li class="logo">
<a id="logo-container" aria-label="Navigate to the beginning of the page" href="#intro"
class="brand-logo grey-blue-text">
<img src="./assets/img/passport-new.png" class="circle img-responsive profile-pic" alt="avatar">
</a>
</li>
<li class="bold">
<a aria-label="Navigate to the About section" href="#intro" class="waves-effect waves-dark teal-text"><i
class="mdi-social-person small"></i><span>A propos</span></a>
</li>
<li class="bold">
<a aria-label="Navigate to the Experience section" href="#experience"
class="waves-effect waves-dark teal-text"><i
class="mdi-action-trending-up small"></i><span>Expériences</span></a>
</li>
<li class="bold">
<a aria-label="Navigate to the Projects section" href="#projects"
class="waves-effect waves-dark teal-text"><i
class="mdi-av-my-library-books small"></i><span>Projets</span></a>
</li>
<li class="bold">
<!--
ICONS:
mdi-action-assessment
mdi-social-poll
mdi-av-equalizer
-->
<a aria-label="Navigate to the Skills section" href="#skills" class="waves-effect waves-dark teal-text"><i
class="mdi-av-equalizer small"></i><span>Compétences</span></a>
</li>
<li class="bold">
<!--
ICONS:
-->
<a aria-label="Navigate to the Education section" href="#education" class="waves-effect waves-dark teal-text"><i
class="mdi-social-school small"></i><span>Formation</span></a>
</li>
<li class="bold">
<!--
1. mdi-communication-contacts
2. mdi-content-mail
3. mdi-communication-email
-->
<a aria-label="Navigate to the Contact section" href="#contact" class="waves-effect waves-dark teal-text"><i
class="mdi-content-mail small"></i><span>Contact</span></a>
</li>
<li class="bold">
<a aria-label="Open Morgan's resume in a new tab" href="./assets/resume/Jeremy_Martin_curriculum.pdf" target="_blank"
class="waves-effect waves-dark teal-text"><i class="mdi-file-folder-open small"></i><span>CV</span></a>
</li>
</ul>
</nav>
<!-- Nav class 2 -->
<nav class="hide-on-large only trigger z-depth-1">
<a aria-label="Toggle visibility of the mobile navbar" href="#" data-activates="slide-out"
class="button-collapse"><i class="mdi-navigation-menu"></i></a>
<div class="name-title">
<a id="name" aria-label="Navigate to the beginning of the page" href="#" class="teal-text">Jérémy Martin</a><span class="black-text">Data Engineer</span>
</div>
</nav>
<!-- Nav class 3 -->
<nav class="hide-on-large only">
<ul id="slide-out" class="side-nav">
<li class="bold">
<a aria-label="Navigate to the About section" href="#intro" class="waves-effect waves-dark teal-text"><i
class="mdi-social-person small"></i><span>A propos</span></a>
</li>
<li class="bold">
<a aria-label="Navigate to the Experience section" href="#experience"
class="waves-effect waves-dark teal-text"><i
class="mdi-action-trending-up small"></i><span>Expériences</span></a>
</li>
<li class="bold">
<a aria-label="Navigate to the Projects section" href="#projects"
class="waves-effect waves-dark teal-text"><i
class="mdi-av-my-library-books small"></i><span>Projets</span></a>
</li>
<li class="bold">
<a aria-label="Navigate to the Skills section" href="#skills"
class="waves-effect waves-dark teal-text"><i
class="mdi-av-equalizer small"></i><span>Compétences</span></a>
</li>
<li class="bold">
<a aria-label="Navigate to the Education section" href="#education" class="waves-effect waves-dark teal-text"><i
class="mdi-social-school small"></i><span>Formation</span></a>
</li>
<li class="bold">
<a aria-label="Navigate to the Contact section" href="#contact" class="waves-effect waves-dark teal-text"><i
class="mdi-content-mail small"></i><span>Contact</span></a>
</li>
<li class="bold">
<a aria-label="Open Jeremy's Resume in a new tab"
href="" target="_blank"
class="waves-effect waves-dark teal-text"><i class="mdi-file-folder-open small"></i><span>CV</span></a>
</li>
</ul>
</nav>
<!-- Main Content-->
<main>
<!-- First Section: Heading lines and image -->
<section id="intro" class="section scrollspy full-height">
<div class="overlay"></div>
<div class="container">
<div class="col-md-9">
<div class="content section-padding valign" style="margin-left: 10%; margin-top: 50px;">
<div class="caption">
<h2><span class="teal">Jérémy Martin</span></h2>
<h5 style="color:#fff">Je suis <span class="typing" style="font-weight: 400; color:#16212a"></span></h5>
<h5>Passionné par l’ingénierie des données et l’assurance qualité, je suis Data Engineer & Data QA Expert, je me spécialise dans la création de pipelines de données robustes.</h5>
<h5>Mon objectif est d’assurer l’intégrité et la performance de vos données, tout en minimisant les risques liés à la qualité des processus.</h5>
<h5>Je suis déterminé à vous fournir des solutions fiables et de haute qualité en mettant à profit mes compétences.</h5>
<h5>Ensemble, transformons vos défis en opportunités grâce à des solutions à forte valeur ajoutée.</h5>
</div>
<div class="social">
<a href="https://www.linkedin.com/in/martin-jeremy/" target="_blank">
<button class="icon-btn linkedin" alt="Look LinkedIn profile.">
<i class="fa fa-linkedin"></i>
</button>
</a>
<a href="https://github.com/martin-jeremy" target="_blank">
<button class="icon-btn github" alt="Look GitHub profile;">
<i class="fa fa-github"></i>
</button>
</a>
</div>
</div>
</div>
</div>
</section>
<!-- Third Section: Experience -->
<section id="experience" class="section scrollspy">
<h3 class="page-title white-text teal">Experience</h3>
<div class="container">
<!-- Skeleton -->
<!-- <div class="card">
<div class="card-content">
<div class="row">
<div class="col s12 m10 center-block">
<span class="card-title">ENTREPRISE</span>
</div>
<div class="role brown-text text-darken-2 center-block">ROLE
</div>
</div>
<div class="flip-content">
<div class="front">
<p>
<b>Projet :</b> //
</p>
<p>
<b>Contexte :</b> //
</p>
<p class="more">Click to see more...</p>
</div>
<div class="back">
<p>
<b>Missions:</b>
<ul>
<li>//</li>
<li>//</li>
<li>//</li>
<li>//</li>
</ul>
</p>
<p>
<b>Environnement Technique :</b> //
</p>
<p>
<b>Equipe :</b> //
</p>
<p>
<b>Lien :</b> <a href="" target="_blank">//</a>
</p>
<p class="more">Click to go back...</p>
</div>
</div>
</div>
<div class="card-action">
<span class="date-lieu">Date | Lieux</span>
</div>
</div> -->
<!-- Latest Experience (EPIDE ~ A4U)-->
<div class="card">
<div class="card-content">
<div class="row">
<div class="col s12 m10 center-block">
<span class="card-title">EPIDE <em>(Alliance4U)</em></span>
</div>
<div class="role brown-text text-darken-2 center-block">Consultant Testeur
</div>
</div>
<div class="flip-content">
<div class="front">
<p>
<b>Projet :</b> Tierce Recette Applicative de la Nouvelle Application Métier (NAMe).
</p>
<p>
<b>Contexte : </b>L'EPIDE (Établissement pour l'insertion dans l'emploi) accompagne les jeunes de 18 à 25 ans sans diplôme ni emploi vers une insertion durable dans la société et le monde du travail, grâce à un cadre combinant formation, citoyenneté et sport. NAMe est l'outil de travail des agents qui centralise et facilite la gestion des démarches administratives, le suivi des jeunes et la coordination des interventions.
</p>
<div class="more">Click to see more...</div>
</div>
<div class="back">
<p>
<b>Missions:</b>
<ul>
<li>Etudier les spécification fonctionnelles.</li>
<li>Rédiger les cas de tests et définir les plans de tests.</li>
<li>Réalisation des campagnes de vérifications et de non régression.</li>
<li>Mise en place et maintient du catalogue de 115 tests automatisés (Click&Record).</li>
</ul>
</p>
<p>
<b>Environnement Technique :</b> Simplicité, Mabl, Jira, XRay.
</p>
<p>
<b>Equipe :</b> 1 test manageur, 1 consultant AMOA, 2 testeurs fonctionnels.
</p>
<p>
<b>Lien :</b> <a href="https://www.epide.fr/" target="_blank">EPIDE</a>
</p>
<div class="more">Click to go back...</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card-action">
<span class="date-lieu">Décembre 2023 - Novembre 2024 | Toulouse <em>(Remote)</em></span>
</div>
</div>
<!-- Experience 2 (NM BIBLIOTHEQUE ~ A4U)-->
<div class="card">
<div class="card-content">
<div class="row">
<div class="col s12 m10 center-block">
<span class="card-title">NANTES METROPÔLE <em>(Alliance4U)</em></span>
</div>
<div class="role brown-text text-darken-2 center-block">Consultant Testeur
</div>
</div>
<div class="flip-content">
<div class="front">
<p>
<b>Projet :</b> Tierce Recette Applicative du site web des Bibliothèques Municipales.
</p>
<p>
<b>Contexte :</b> La métropôle de Nantes compte 8 Bibliothèques et 2 médiathèques. Dans le cadre de sa digitalisation, la ville a fait appel à un prestataire externe pour concevoir et réaliser un site web basé sur la technologie WordPress. La société Alliance4U a obtenue le marché de TRA pour assurer la vérification et la conformité avec les spécification fonctionnelles et le Plan d'Assurance Qualité de Nantes Métropôle.
</p>
<div class="more">Click to see more...</div>
</div>
<div class="back">
<p>
<b>Missions:</b>
<ul>
<li>Etudier les spécification fonctionnelles et le plan d'assurance qualité.</li>
<li>Rédiger le cahier de recette et les cas de tests (Fonctionnel, API, Intégreation).</li>
<li>Définir et mettre en place les jeux de données pour la bonne exécution des plan de tests.</li>
<li>Réaliser les campagnes de vérifications, le repporting et mise en place des livrables pour le client.</li>
</ul>
</p>
<p>
<b>Environnement Technique :</b> Jira XRay, Squash, WordPress.
</p>
<p>
<b>Equipe :</b> 1 testeur fonctionnel.
</p>
<p>
<b>Lien :</b> <a href="https://bibliotheque.nantes.fr/" target="_blank">Nantes Ma Bibliothèque</a>
</p>
<div class="more">Click to go back...</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card-action">
<span class="date-lieu">Janvier 2024 | Toulouse <em>(Remote)</em></span>
</div>
</div>
<!-- Experience 3 (ALLIANCE4U ~ C-SIL / STEM)-->
<div class="card">
<div class="card-content">
<div class="row">
<div class="col s12 m10 center-block">
<span class="card-title">ALLIANCE4U</span>
</div>
<div class="role brown-text text-darken-2 center-block">
Consultant
</div>
</div>
<div class="flip-content">
<div class="front">
<p>
<b>Projet :</b> C-SIL, le Système d'Information de Laboratoire de recherche collaboratif.
</p>
<p>
<b>Contexte :</b> Le LAB A4U, incubateur interne, soutient les projets des collaborateurs. C-SIL (socle applicatif) et STEM (module analytique), issus de cet incubateur, standardisent le traitement des données transcriptomiques tout en remettant le biologiste au coeur du processus et en réduisant les délais de traitement par les plateformes techniques. Après un POC réussi, nous avons souhaité co-construire la solution dans le cadre d'un partenariat académique.
</p>
<div class="more">Click to see more...</div>
</div>
<div class="back">
<p>
<b>Mission :</b>
<ul>
<li>Présenter l'idée au sein du LAB.</li>
<li>Concevoir un POC fonctionnel du module STEM.</li>
<li>Définir le modèle de financement de la conception jusqu'à N+2.</li>
<li>Présenter le projet aux grands acteurs locaux de la recherche académique.</li>
<li>Identifier les axes de collaborations possible pour co-construire la solution en partenariat avec un acteur académique (CNRS, INSERM, INRAE...)</li>
</ul>
</p>
<p>
<b>Environnement Technique :</b> Python, Flask, Docker, MongoDB, VueJS.
</p>
<p>
<b>Equipe :</b> 1 Expert UI/UX, 1 Dev Front, 1 Dev Back.
</p>
<div class="more">Click to go back...</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card-action">
<span class="date-lieu">Octobre 2023 - Janvier 2024 | Toulouse</span>
</div>
</div>
<!-- Experience 4 (Immception Lab ~ INSERM) -->
<div class="card">
<div class="card-content">
<div class="row">
<div class="col s12 m10 center-block">
<span class="card-title">INFINITY <em>(INSERM UMR1291)</em></span>
</div>
<div class="role brown-text text-darken-2 center-block">
Bio Informatique
</div>
</div>
<div class="flip-content">
<div class="front">
<p>
<b>Projet :</b> Ingénieur au sein de l'Immception Lab (N. Gaudenzio).
</p>
<p>
<b>Contexte :</b> L'équipe du Dr Nicolas Gaudenzio travaille sur la régulation neuronale de la réponse immunitaire. Dans ce cadre, elle mène de nombreux travaux de recherche à la frontière entre neurosciences et immunologie. Ces recherches utilisent les dernières technologies de séquençage à haut débit (RNA-seq, scRNA-seq, proteomiques etc...) et génèrent une grande quantité de données à traiter de bout en bout.
</p>
<div class="more">Click to see more...</div>
</div>
<div class="back">
<p>
<b>Missions :</b>
<ul>
<li>Mettre en place un pipeline de traitement pour automatiser le prétraitement de <strong>+2 To</strong> de données de séquençage.</li>
<li>Concevoir une <strong>base de données SQLite</strong> avec 150 interactions moléculaires d'intérêt pour le laboratoire.</li>
<li>Développer une <strong>WebApp RShiny</strong> pour faciliter la prise en main des données par les biologistes.</li>
<li>Contribuer au rayonnement scientifique :
<ul>
<li><strong>5 publications scientifiques</strong>, dont 2 collaborations internationales.</li>
<li><strong>2 invitations en tant que speaker</strong> aux journées scientifiques régionales de GenoToul.</li>
</ul>
</li>
<li><strong>Encadrer des étudiants</strong> de Master 1 <em>(projet tutoré)</em> et de Master 2 <em>(stage de fin d'études)</em> du Master Bioinformatique de Toulouse.</li>
</ul>
</p>
<p>
<b>Environnement Technique :</b> HPC SLURM, Bash / Linux, R, RShiny, Python, Streamlit, MariaDB, SQL, Git.
</p>
<p>
<b>Equipe :</b> 1 DR, 1 CRCN, 3 Post Doc, 3 Doctorantes.
</p>
<p>
<b>Liens :</b> <a href="https://www.infinity.inserm.fr/equipes-de-recherche-2/equipe-3-n-gaudenzio/" target="_blank">INFINITY - Equipe 3 - Gaudenzio Lab</a>
</p>
<div class="more">Click to go back...</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card-action">
<span class="date-lieu">Janvier 2021 - Septembre 2023 | Toulouse</span>
</div>
</div>
</div>
</section>
<!-- Fourth Section: Projects -->
<section id="projects" class="section scrollspy">
<h3 class="page-title white-text teal">Projets</h3>
<div class="container">
<div class="row">
<div class="col s12 m6 l4">
<div class="card medium">
<div class="card-image waves-effect waves-block waves-light" style="display: flexbox; justify-content: center;align-content: center;">
<img alt="stem logo" src="./assets/img/this.png" style="object-fit: contain; height: 100%;" class="activator" />
</div>
<div class="card-content" style="overflow-y: auto;">
<span class="card-title activator teal-text hoverline">Ce Portfolio<i
class="mdi-navigation-more-vert right"></i></span>
<p >
Site personnel pour me présenter, mon parcours et mon activités.
</p>
</div>
<div class="card-reveal">
<span class="card-title grey-text"><small>Accomplishments</small><i
class="mdi-navigation-close right"></i></span>
<ul>
<li><b>Outils:</b> HTML, CSS, JS <em>(un peu)</em>, FastAPI, Render, Git, Github Action, Github Pages, Github.</li>
<li>Basé sur un template.</li>
<li>CSS entièrement personnalisé.</li>
<li>Flip des <strong>#experience cards</strong> mis en place en pure CSS.</li>
<li>Merci de votre visite !</li>
</ul>
<div class="card-action">
<a aria-label="Visit " href="http://martin-jeremy.github.io" target="_blank" data-position="bottom"
data-tooltip="View Online"
class="btn-floating btn-large waves-effect waves-light blue-grey tooltipped"><i
class="fa fa-external-link"></i></a>
<a aria-label="Visit the GitHub repo for project" href="https://github.com/martin-jeremy/martin-jeremy.github.io"
target="_blank" data-position="bottom" data-tooltip="View Source"
class="btn-floating btn-large waves-effect waves-light blue-grey tooltipped"><i
class="fa fa-github"></i></a>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="col s12 m6 l4">
<div class="card medium">
<div class="card-image waves-effect waves-block waves-light" style="display: flexbox; justify-content: center;align-content: center;">
<img alt="stem logo" src="./assets/img/stem.png" style="object-fit: contain;" class="activator" />
</div>
<div class="card-content" style="overflow-y: auto;">
<span class="card-title activator teal-text hoverline">STEM<i
class="mdi-navigation-more-vert right"></i></span>
<p >
Module d'analyse de donnée scRNA seq.
</p>
</div>
<div class="card-reveal">
<span class="card-title grey-text"><small>Accomplishments</small><i
class="mdi-navigation-close right"></i></span>
<ul>
<li><b>Outils:</b> Python, Flask, VueJS, MongoDB, Git, Bitbucket, Docker.</li>
<li>Gestion des différents projets experimentaux.</li>
<li>Algorithme de pré-traitement des données paramétrable.</li>
<li>Mise en place d'un onglet de visualisation de features.</li>
<li>Formulaire d'identification des clusters basés sur les niveaux d'expressions de marqueurs clefs.</li>
</ul>
</div>
</div>
</div>
<div class="col s12 m6 l4">
<div class="card medium">
<div class="card-image waves-effect waves-block waves-light" style="display: flexbox; justify-content: center;align-content: center;">
<img alt="stem logo" src="./assets/img/toolbox-featureplot.png" style="object-fit: contain; height: 100%;" class="activator" />
</div>
<div class="card-content" style="overflow-y: auto;">
<span class="card-title activator teal-text hoverline">Toolbox - FeaturePlot<i
class="mdi-navigation-more-vert right"></i></span>
<p >
Outils de visualisation de données scRNA seq.
</p>
</div>
<div class="card-reveal">
<span class="card-title grey-text"><small>Accomplishments</small><i
class="mdi-navigation-close right"></i></span>
<ul>
<li><b>Outils:</b> R, RShiny, Git, Github.</li>
<li>Mise en place de jeux de tests pour se familiariser avec l'outil.</li>
<li>Possibilité d'uploader son propre data set.</li>
<li>Gestion des différents aspects de DataViz.</li>
<li>Hebergement sur ShinyApps.io </li>
</ul>
<div class="card-action">
<a aria-label="Visit " href="https://martin-jeremy.shinyapps.io/featureplot/" target="_blank" data-position="bottom"
data-tooltip="View Live"
class="btn-floating btn-large waves-effect waves-light blue-grey tooltipped"><i
class="fa fa-play-circle"></i></a>
<a aria-label="Visit the GitHub repo for project" href="https://github.com/martin-jeremy/toolbox-featureplot"
target="_blank" data-position="bottom" data-tooltip="View Source"
class="btn-floating btn-large waves-effect waves-light blue-grey tooltipped"><i
class="fa fa-github"></i></a>
</div>
</div>
</div>
</div>
<!-- ************* -->
</div>
</div>
</section>
<!-- Fifth Section: Skills -->
<section id="skills" class="section scrollspy">
<h3 class="page-title white-text teal">Compétences</h3>
<div class="container">
<!-- Languages -->
<div class="card">
<div class="card-content">
<h4 class="brown-text light">Languages</h4>
<div class="row text-center">
<div class="col s4 m2">
<img alt="python" src="./assets/img/python-logo-1-300x300.jpg" class="responsive-img" />Python
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="html" src="./assets/img/html5-300x300.jpg" class="responsive-img" />HTML5
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="css" src="./assets/img/css3-300x300.jpg" class="responsive-img" />CSS3
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="shell" src="./assets/img/shell-logo-1-300x300.jpg" class="responsive-img" />Shell Scripting
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="R" src="./assets/img/R_logo.png" class="responsive-img" />R
</div>
</div>
</div>
</div>
<!-- Databases -->
<div class="card">
<div class="card-content">
<h4 class="brown-text light">Manipulation des données</h4>
<div class="row text-center">
<div class="col s4 m2">
<img alt="sql" src="./assets/img/SQL_logo.png" class="responsive-img" />SQL
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="duckdb" src="./assets/img/duckdb.jpg" class="responsive-img" style="border-radius: 15px;"/>DuckDB
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="pandas" src="./assets/img/pandas-logo-2-500x500.jpg" class="responsive-img" />Pandas
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="numpy" src="./assets/img/numpy-logo-1-500x500.jpg" class="responsive-img" />Numpy
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="tidyverse" src="./assets/img/Tidyverse_hex_logo.png" class="responsive-img" />Tidyverse
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="spark" src="./assets/img/spark_logo.png" class="responsive-img" />Spark
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card">
<div class="card-content">
<h4 class="brown-text light">Machine learning</h4>
<div class="row text-center">
<div class="col s4 m2">
<img alt="scikit learn" src="./assets/img/sk-learn-logo-1-500x500.jpg" class="responsive-img" />Sklearn <em>(Python)</em>
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="caret" src="./assets/img/R_caret_500x500.jpeg" class="responsive-img" style="border-radius: 15px;"/>Caret <em>(R)</em>
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="keras" src="./assets/img/keras_logo.png" class="responsive-img" />Keras <em>(Python/R)</em>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card">
<div class="card-content">
<h4 class="brown-text light">Cloud</h4>
<div class="row text-center">
<!-- <div class="col s4 m2">
<img alt="" src="./assets/img/GCP_logo.png" class="responsive-img" />Google Cloud Platform
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="" src="./assets/img/AWS_logo.png" class="responsive-img" />Amazon Web Services
</div> -->
<div class="col s4 m2">
<img alt="Render" src="./assets/img/render_logo.webp" class="responsive-img" />Render
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="GHPages" src="./assets/img/github_logo.svg" class="responsive-img" />Github Pages
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card">
<div class="card-content">
<h4 class="brown-text light">Visualisation des données</h4>
<div class="row text-center">
<div class="col s4 m2">
<img alt="matplotlib" src="./assets/img/matplotlib_logo.png" class="responsive-img" />Matplotlib
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="seaborn" src="./assets/img/seaborn_logo.svg" class="responsive-img" />Seaborn
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="ggplot2" src="./assets/img/Ggplot2_hex_logo.png" class="responsive-img" />ggplot2
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="plotly" src="./assets/img/plotly.png" class="responsive-img" style="border-radius: 10px;"/>Plotly
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card">
<div class="card-content">
<h4 class="brown-text light">Tests</h4>
<div class="row text-center">
<div class="col s4 m2">
<img alt="pytest" src="./assets/img/pytest_logo.svg" class="responsive-img" />Pytest
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="mabl" src="./assets/img/mabl.jpg" class="responsive-img" style="border-radius: 15px;"/>mabl
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card">
<div class="card-content">
<h4 class="brown-text light">API</h4>
<div class="row text-center">
<div class="col s4 m2">
<img alt="fastapi" src="./assets/img/fastapi_logo.svg" class="responsive-img" />FastAPI
</div>
<!-- <div class="col s4 m2">
<img alt="" src="./assets/img/pydantic_logo.jpg" class="responsive-img" />Pydantic
</div> -->
</div>
</div>
</div>
<div class="card">
<div class="card-content">
<h4 class="brown-text light">Prototype web</h4>
<div class="row text-center">
<div class="col s4 m2">
<img alt="flask" src="./assets/img/flask_500x500.png" class="responsive-img" />Flask
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="streamlit" src="./assets/img/streamlit_500x500.jpg" class="responsive-img" />Streamlit
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="rshiny" src="./assets/img/rshiny_logo.png" class="responsive-img" />Rshiny
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card">
<div class="card-content">
<h4 class="brown-text light">Orchestrateur</h4>
<div class="row text-center">
<div class="col s4 m2">
<img alt="slurm" src="./assets/img/slurm_logo.png" class="responsive-img" />AirFlow
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="airflow" src="./assets/img/airflow_logo.png" class="responsive-img" />AirFlow
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card">
<div class="card-content">
<h4 class="brown-text light">Gestion du code</h4>
<div class="row text-center">
<div class="col s4 m2">
<img alt="github" src="./assets/img/github_logo.svg" class="responsive-img" />Github
</div>
<div class="col s4 m2">
<img alt="github action" src="./assets/img/github_action_logo.png" class="responsive-img" />Github action
</div>
<!-- <div class="col s4 m2">
<img alt="poetry" src="./assets/img/poetry_logo.jpeg" class="responsive-img" />Poetry
</div> -->
<!-- <div class="col s4 m2">
<img alt="docker" src="./assets/img/docker_logo_500x500.webp" class="responsive-img" />Docker
</div> -->
</div>
</div>
</div>
</div>
</section>
<!-- Seventh Section: Education -->
<section id="education" class="section scrollspy">
<h3 class="page-title white-text teal">Formation</h3>
<div class="container">
<div class="row">
<!-- Education -->
<div class="card">
<div class="card-content">
<div class="row">
<div class="col s12 m10 center-block">
<span class="card-title">Data-Upskilling</span>
</div>
<div class="role brown-text text-darken-2 center-block">
Benjamin Dubreux
</div>
</div>
<div class="flip-content">
<div class="front">
<p>
<b>Résumé :</b> Une formation dédiés aux Data Analyst et Data Scientist désireux de s'orienter dans le Data Engineering.
</p>
<p>
<b>Description :</b> Benjamin Dubreux est freelance dans la data depuis bientôt 10 ans. Il a vu le paysage de la data évolué et a identifié le socle technique indispensable pour pouvoir performer dans ces métiers.
</p>
<div class="more">Click to see more...</div>
</div>
<div class="back">
<p>
<b>Modules :</b>
<ul>
<li>Bash et Linux</li>
<li>SQL et SQL Avancés <strong><em>(CTE, Window Function, Joins,...)</em></strong></li>
<li>Python Pro <strong><em>(FastAPI, Streamlit)</em></strong></li>
<li>Data Engineering <strong><em>(Airflow, Spark)</em></strong></li>
</ul>
</p>
<p>
<b>Lien :</b> <a href="https://www.formations-data.fr/methode_skill_market_fit_accueil" target="_blank">Formation Data</a>
</p>
<div class="more">Click to go back...</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card-action">
<span class="date-lieu">Juillet 2024 | Toulouse <em>(Remote On-Demand)</em></span>
</div>
</div>
</div>
<div class="row">
<div class="col s12 m6 l6">
<div class="card">
<div class="card-content">
<p>
<span class="card-title"><a href="" target="_blank" class="teal-text hoverline"></a>ISTQB CFTL (v4)</a></span>
</p>
<p class="brown-text">Alliance Academy | 2023 - Toulouse</p>
<p>
<em>ISTQB Certified Foundation Tester Level</em>
</p>
<p>
<b>Certification :</b> <em>22/12/2023</em>
</p>
<center>
<a href="https://app.skillsclub.com/credential/49138-ddec7ac423726b6ad77befde5ad293049365e4a8c6fa32c225b2298663275ac8" target="_blank">
<img src="./assets/img/gasq_istqb.png" class="responsive-img" width="23%">
</a>
</center>
</div>
</div>
</div>
<div class="col s12 m6 l6">
<div class="card">
<div class="card-content">
<p>
<span class="card-title"><a href="" target="_blank" class="teal-text hoverline"></a>Practicals on machine and deep learning using R and Keras</a></span>
</p>
<p class="brown-text">GenoToul Biostatistique | 2022 Toulouse</p>
<p>
<b>Description :</b> Prise en main de Keras via la librairie R : One Hot Encoding d'une sequence genomique et application d'un CNN pour identification de motifs d'intérêt.
</p>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="row">
<div class="card">
<div class="card-content">
<div class="row">
<div class="col s12 m10 center-block">
<span class="card-title">Master Bioinformatique et Biologie des Systèmes</span>
</div>
<div class="role brown-text text-darken-2 center-block">
UT3 Paul Sabatier
</div>
</div>
<div class="flip-content">
<div class="front">
<p>
<b>Résumé :</b> La bioinformatique est un domaine interdisciplinaire qui combine des outils informatiques et des techniques d'ingénierie logicielle pour stocker, analyser et modéliser de vastes ensembles de données biologiques.
</p>
<p>
<b>Description :</b> Ce master forme des experts capables d'utiliser des techniques informatiques avancées et des approches d'ingénierie logicielle pour analyser et modéliser de grandes quantités de données biologiques, tout en se spécialisant dans des domaines tels que la santé, les biotechnologies, et l'agronomie.
</p>
<div class="more">Click to see more...</div>
</div>
<div class="back">
<p>
<b>Cours significatif :</b>
<ul class="columns_list">
<li>Algorithmique</li>
<li>Théorie des Graphes</li>
<li>Programmation pour la biologie <em>(Python)</em></li>
<li>Introduction à Java</li>
<li>Bases de données relationnelles <em>(SQL)</em></li>
<li>Base de données avancées <em>(PL/SQL, Trigger, ...)</em></li>
<li>Fouille de données</li>
<li>Introduction à l'apprentissage automatique <em>(ML/DL)</em></li>
<li>Biostatistiques</li>
<li>Mathématiques appliquées</li>
<li>Analyse multivariées et modélisation statistiques</li>
<li>Bioinformatique des séquences</li>
<li>Bioinformatique post-génomique <em>(sequençage next-Gen)</em></li>
<li>Biologie des systèmes</li>
</ul>
</p>
<p>
<b>Liens :</b> <a href="https://formations.univ-toulouse.fr/fr/les-formations/master-lmd-XB/bio-informatique-IY5KNOMH/master-parcours-bioinformatique-et-biologie-des-systemes-bbs-FIN_5291.html" target="_blank">Master BBS - UT3</a>
</p>
<div class="more">Click to go back...</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="card-action">
<span class="date-lieu">Septembre 2019 - Juin 2021 | Toulouse</span>
</div>
</div>
</div>
<div class="row">
<div class="col s12 m6 l6">
<div class="card">
<div class="card-content">
<p>
<span class="card-title"><a href="" target="_blank" class="teal-text hoverline"></a>Licence Biologie </a></span>
</p>
<p class="brown-text">UT3 Paul Sabatier | Toulouse</p>
<p>
<b>Mention :</b> Biochimie, Biologie Moléculaire, Microbiologie
</p>
<p>
<b>Option :</b> <em>Gestion de Projet</em> et <em>Immunologie Avancée</em>
</p>
</div>
</div>
</div>
<div class="col s12 m6 l6">
<div class="card">
<div class="card-content">
<p>
<span class="card-title"><a href="" target="_blank" class="teal-text hoverline"></a>BTS Analyse de Biologie Médicales</a></span>
</p>
<p class="brown-text">Lycée Dr Lacroix | Narbonne</p>
<p>
<b>Option :</b> <em>Certificat de prélèvement sanguin</em>
</p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</section>
<!-- Eight Section: Contact -->
<section id="contact" class="section scrollspy full-height">
<h3 class="page-title white-text teal">Contact</h3>
<!-- <div class="container">
<p>
<a aria-label="Email Morgan" href="mailto:gautherotmorgan0@gmail.com" target="_blank" data-position="top"
data-tooltip="Email Morgan" class="btn-floating btn-large waves-effect waves-light blue-grey tooltipped"><i
class="fa fa-envelope"></i><a aria-label="Email Morgan" href="mailto:gautherotmorgan0@gmail.com"
class="hoverline">gautherotmorgan0@gmail.com</a></a>
</p>
<p>
<a aria-label="View Morgan on GitHub" href="https://github.com/MorganGautherot" target="_blank"
data-position="top" data-tooltip="View Morgan on GitHub"
class="btn-floating btn-large waves-effect waves-light blue-grey tooltipped"><i class="fa fa-github"></i><a
aria-label="Morgan on Github" href="https://github.com/MorganGautherot" class="hoverline"
target="_blank">github.com/MorganGautherot</a></a>
</p>
<p>
<a aria-label="View Morgan on LinkedIn" href="https://www.linkedin.com/in/morgan-gautherot-phd-05a227108/" target="_blank"
data-position="top" data-tooltip="View Morgan on LinkedIn"
class="btn-floating btn-large waves-effect waves-light blue-grey tooltipped"><i
class="fa fa-linkedin"></i><a aria-label="Morgan on LinkedIn" href="https://www.linkedin.com/in/morgan-gautherot-phd-05a227108/"
class="hoverline" target="_blank">linkedin.com/in/morgan-gautherot-phd</a></a>
</p>
</div> -->
<!-- Try to put a contact form -->
<div class="container">
<div class="contact-intro">
<p class="contact-description">
Vous pouvez me contacter via ce formulaire, je vous répondrais dans les plus brefs délais.
</p>
</div>
<form class="contact-form" action="https://martin-jeremy-api.onrender.com/submit-form/" method="POST">
<div class="form-group-container" style="display: flex; flex-direction: column;">
<div class="form-group">
<label for="name" class="form-label">Nom*</label>
<input id="name" name="name" class="form-input" placeholder="Votre nom" type="text" required/>
</div>
<div class="form-group">
<label for="email" class="form-label">Email*</label>
<input id="email" name="email" class="form-input" placeholder="Votre email" type="email" required/>
</div>
<div class="form-group">
<label for="phone" class="form-label">Téléphone</label>
<input id="phone" name="phone" class="form-input" placeholder="+33 (0) 612345789" type="text" />
</div>
<div class="form-group">
<label for="message" class="form-label">Message*</label>
<textarea class="form-textarea" id="message" name="message" placeholder="Votre message" required></textarea>
</div>
</div>
<button class="form-submit" type="submit" id="submit-contact"><i class="fa fa-send"></i> Envoyer</button>
</form>
</div>