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LiuLab-CSRC/DataViewer

 
 

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DataViewer 使用说明

English

简介

这是一个数据可视化工具,主要为单颗粒散射的数据分析开发。

  1. 2dViewer : 二维散射数据的展示,以及一些分析
  2. maskMaker : 二维图像遮罩的制作
  3. 3dViewer : 三维数据的展示

安装环境

本程序基于Anaconda环境开发。

  1. 安装Anaconda 3;
  2. 运行“make.sh”脚本(只支持Linux和苹果系统),或者使用包内提供的“environment.yaml”文件自行配置环境。

使用

  1. 二维数据展示
python ./2dViewer/viewer.py
  1. 制作二维图像遮罩
python ./2dViewer/maskMaker.py
  1. 三维数据展示
python ./3dViewer/viewer.py

使用文档

(1)3dViewer

首先,从左侧文件选择器选择想要展示的数据,再点击下方“Import Selected File”按钮加载即可。用户可以在右侧下方控制栏中选择多种绘图模式(名为“Plot”的下拉菜单)。

【动图制作器】

点击“Rotate and Movie”按钮(右侧下方控制栏内),可以控制绘图场景的旋转并且录制动图。

  • 制作动图 : 在弹出窗口中设置总时长并点击“Make Movie”按钮即可。在弹窗左下角可以查看制作进度。
  • 旋转 : 点击“Rotate”按钮,仅对绘图场景进行旋转。

【数据格式】

  • 目前支持“.npy”(Numpy数据),“.mat”(Matlab数据),“.bin”(二进制),".h5"(HDF5格式)文件。

  • 标量绘图 : 绘制标量数据,数据矩阵应为三维

    • 矩阵形状=(Nx,Ny,Nz)
  • 向量绘图 : 绘制向量数据,数据矩阵应为二维,6行N列。

    • 6行分别为(X坐标,Y坐标,Z坐标,X方向速度,Y方向速度,Z方向速度)
    • N列,即一共N个数据点
  • 离散点绘图 : 对三维空间的离散点进行绘制,可带强度值,数据矩阵应为二维,3或4行,N列。

    • 4行分别为(X坐标,Y坐标,Z坐标,强度)
    • N列,即一共N个数据点

(2)2dViewer

二维数据展示程序使用简单,直接将HDF5文件、Numpy数据文件、Matlab数据文件或TIF文件拖拽到右侧文件树下,双击相应数据即可。

在“Parameter”选项卡中可调节各种显示参数。

(3)2D 数据遮罩

程序提供形状的三种遮罩工具:

  • 圆遮罩工具
  • 矩形遮罩工具
  • 多边形遮罩工具

通过调节这些工具的大小和位置,可以组合出任意的遮罩形状。

  • 右键单击遮罩工具 : 将该工具圈定的范围纳入当前数据遮罩
  • 左键双击遮罩工具 : 将该工具圈定的范围从当前数据遮罩中除去
  • 右键单击文件树中的遮罩文件 : 显示下拉菜单,可将选中文件(必须二维)设置为当前遮罩,或加入到当前遮罩中去。

同样,“Parameter”选项卡提供了很多重要的参数设置,其中“Mask Good”和“Mask Bad”分别定义了读写遮罩文件时,无遮罩部分和被遮罩部分的数据值。

Releases

No releases published

Packages

No packages published

Languages

  • Python 99.5%
  • Shell 0.5%