La idea de este pequeño proyecto fue encontrar un método automatizado para agregar a los registros de una biblioteca de EndNote (EndNote 20 v.: 20.2.1) sus respectivos DOI (Digital Object Identifier).
Archivo principal de ejecución: main.ipynb. Contiene la orquestación del pipeline y su documentación paso por paso.
(Compatible con PostgreSQL v.9.5 en adelante)
Extracción: /extraer_desde_Xml
Se usó la funcionalidad de exportación de Endnote para transformar toda la biblioteca a .xml.
Usado paquete xml.etree.ElementTree para parsear el archivo .xml generado desde Endnote.
Carga a DB /Carga a postgreSQL
Se empleó psql, y el módulo de python psycopg2.
2. Buscar por título los DOI que faltan (API de crossref) e insertarlos en su respectiva columna de la tabla. /Completar doi
Uso de API de CrossRef, con librerias de python. Probado y descartado módulo crossrefapi. Empleado al final habanero. Función de búsqueda: completar_doi.add_doi.buscar_doi_v0.
Resultados de búsqueda almacenados temporalmente en BD postgreSQL.
Inicialmente se probó la generación de .enw para cada registro (Endnote los usa para insertar registros nuevos). Al final, se recurrió a la edición del archivo .xml de exportación, agregando las etiquetas correspondientes al doi (electronic-resource-num) donde fueran necesarias (xml_doi)
<electronic-resource-num>
<style face="normal" font="default" size="100%">...</style>
</electronic-resource-num>
La cadena de texto luego se formateó y guardó como .xml compatible con EndNote.
Luego se empleó la funcionalidad de importación de Endnote para generar la biblioteca actualizada.