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A system for drawing phylogenetic trees and inferring species evolution paths based on artificial intelligence technology.

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AITD-System

一种基于人工智能技术的系统发生树绘制与物种演化路径推断系统

A system for drawing phylogenetic trees and inferring species evolution paths based on artificial intelligence technology.

河南省青少年科技创新大赛参赛作品

participated in the Henan Youth Science and Technology Innovation Competition

摘要 Abstract:

近些年来,随着分子生物学的发展,基因序列与蛋白质序列越来越多地被作为绘制系统发生树的重要参考依据,从中诞生了很多相应的技术。但是,这些技术在实践过程中,仍存在着一些问题。比如参考序列选择比较困难等,这些都给绘制出的系统发生树的准确性与严谨性带来了一定的影响。在本文中,笔者搭建了一套用于绘制系统发生树的计算机应用软件,这套系统集成了一些常用的比对与建树算法,同时,该系统还综合了近期的相关科研数据,使用了人工智能(AI)技术以对建成的系统发生树进行综合分析,从而得出最优异的、最能代表真实物种演化路径的系统发生树,这一突破,能够使得研究人员无需拘泥于参考序列的选择,可缩短科研周期,提升科研效率。同时,本系统包括了插件系统,这使得用户可以自定义需要的序列比对与建树算法,可扩展性更强。该系统的综合能力优于目前市面上的几款解决方案,使物种演化路径的推断过程变得更加便利、准确,对相关的科研工作可能会起到推进作用。

第一作者 First author:

共同作者 Co-authors:

其他参与者 Participant:

训练数据 Training data:

AITD-training

论文 Paper:

AITD-thesis

单位 Author's organization:

河南科技大学附属高级中学(周山校区), 471031

The High School Affiliated to University of Science & Technology Henan

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A system for drawing phylogenetic trees and inferring species evolution paths based on artificial intelligence technology.

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