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saramortara/aula_MNRJ

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Bases de dados de biodiodiversidade: conceitos e usos

Aula sobre bases de dados de biodiversidade no contexto de coleções biológicas.

  • Aula teórica (disponível aqui)

  • Demonstração em R de manipulação e limpeza de dados seguindo os scripts disponíveis neste repositório

Roteiro da aula prática:

  1. Manipulação de dados em formato DarwinCore usando o checklist de peixes da Colômbia disponível em: https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=ictiofauna_colombiana_dulceacuicola

  2. Rotina de limpeza taxonômica com os peixes endêmicos da Colômbia (um subconjunto de 1)

  3. Carregando e manipulando dados da coleção Ictiológica do MNRJ disponível na plataforma SiBBr

  4. Rotina de limpeza geográfica com os Astyanax da coleção Ictiológica do MNRJ (subconjunto de 3)

Estrutura de pastas do repositório:

.
├── aula_MNRJ.Rproj       # projeto de RStudio
├── data                  # dados brutos e processados
├── figs                  # figuras geradas pelos scripts
├── README.md
└── scripts               # scripts de R

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Aula sobre bases de dados de biodiversidade

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