这是一项正在进行的工作。本仓库将公开书稿内容和源代码，欢迎读者指正。当前进度：
- 第1章：经典力学基础（在写）。
- 第2章：热力学与经典统计力学基础（在写）。
- 第3章：一个简单的分子动力学模拟程序（已经完成）。
- 第4章：模拟盒子；近邻列表（已经完成）。
- 第5章：势函数（包括经验势和机器学习势）（在写）。
- 第6章：控温算法、控压算法及一些平衡态性质的计算 (在写)。
- 第7章：输运性质的分子动力学模拟（在写）。
- 第8章：路径积分MD (在写)。
- 第9章：预计写自由能计算。
- 读者可加入作者的 QQ 群： 887975816。
- 该群主要讨论分子动力学模拟中的算法和作者开发的 GPUMD 程序 (https://gpumd.org) 的使用。